Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Krt78-201ENSMUST00000164932 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cbx1P83917 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms