Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Tubg1P83887 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms