Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcr4P70658 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms