Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Hoxd13P70217 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Hoxd13P70217 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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