Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Lrig1P70193 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms