Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vbp1P61759 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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