Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CdaP56389 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CdaP56389 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms