Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Tmod1P49813 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Tmod1P49813 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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