Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
TtlP38585 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TtlP38585 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms