Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms