Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VtnP29788 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VtnP29788 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms