Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms