Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gjb1P28230 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gjb1P28230 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms