Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gabrg3P27681 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms