Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prim1P20664 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms