Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PrkcaP20444 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms