Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SagP20443 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SagP20443 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SagP20443 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms