Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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PcnaP17918 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms