Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P10404 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P10404 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms