Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P06344 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P06344 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P06344 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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