Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-Eb1P04230 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-Eb1P04230 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-Eb1P04230 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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H2-Eb1P04230 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
H2-Eb1P04230 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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