Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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BckdkO55028 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BckdkO55028 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BckdkO55028 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BckdkO55028 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BckdkO55028 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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BckdkO55028 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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BckdkO55028 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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