Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
DffaO54786 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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DffaO54786 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DffaO54786 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DffaO54786 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DffaO54786 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DffaO54786 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DffaO54786 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DffaO54786 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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DffaO54786 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DffaO54786 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms