Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pkd2O35245 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2O35245 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pkd2O35245 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pkd2O35245 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pkd2O35245 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pkd2O35245 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pkd2O35245 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pkd2O35245 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms