Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms