Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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BC024978J3QPC3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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BC024978J3QPC3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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BC024978J3QPC3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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BC024978J3QPC3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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BC024978J3QPC3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BC024978J3QPC3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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