Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Gm17577J3QNF7 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms