Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20815J3KMI0 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms