Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm3371F7CQW8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms