Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6F6VAN0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms