Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm7138-201ENSMUST00000167669 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm38220-201ENSMUST00000195774 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fndc1E9Q043 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Krtap21-1-201ENSMUST00000078422 748 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fndc1E9Q043 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms