Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Phf11bB4XVQ1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Phf11bB4XVQ1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Phf11bB4XVQ1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Phf11bB4XVQ1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
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