Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Phf11cB4XVP9 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms