Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usf3B2RUQ2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms