Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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