Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms