Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pramef6A2A8M8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms