Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A0A0U1RNP2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms