Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms