Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn8Q9Z260 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms