Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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