Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Fhl3Q9R059 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms