Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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