Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Col5a3Q9JLI2 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Col5a3Q9JLI2 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms