Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tlr5Q9JLF7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms