Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tgm1Q9JLF6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tgm1Q9JLF6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms