Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
C1ql3Q9ESN4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
C1ql3Q9ESN4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms