Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rnft1Q9DCN7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms