Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syde1Q9DBZ9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms