Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr1043-201ENSMUST00000099907 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms